武德元年（戊寅年，公元618年）
武德元年（戊寅年，公元618年）春季，正月初一，隋恭帝下詔書，允許唐王李淵佩劍穿鞋上殿，朝拜時司儀不用直呼他的名字（這是古代對大臣的極高禮遇）。唐王攻克長安后，寫信招撫各地郡縣，于是東起商洛，南到巴蜀，各地的郡縣長官、盜賊首領、氐羌部落酋長，都爭相派子弟前來拜見請降，有關部門回復的書信，每天多達上百封。
王世充得到東都洛陽的軍隊后，在洛水北岸進攻李密，打敗了他，隨后駐軍鞏縣北面。正月十五日，王世充命令各軍分別建造浮橋渡過洛水攻打李密，先造好浮橋的軍隊先進攻，導致各軍前后行動不一致。虎賁郎將王辯攻破了李密的外圍營寨，李密軍營中一片混亂，眼看就要潰敗；但王世充不知道這一情況，反而吹響號角收兵，李密趁機率領敢死隊發起反擊，王世充大敗，士兵爭相過橋淹死的有一萬多人。王辯戰死，王世充僅自身逃脫，洛水北岸的各路軍隊全部潰敗。王世充不敢退回東都，向北逃往河陽。當天夜里，天降寒風冷雨，士兵蹚水過河被浸濕，在路邊凍死的又有一萬多人。王世充只帶著幾千人到達河陽，自己把自己關進監獄請求治罪，越王楊侗派使者赦免了他，召他返回東都，賞賜金銀綢緞、美女來安撫他。王世充收攏逃散的士兵，得到一萬多人，駐軍含嘉城，不敢再出兵。
李密乘勝進占金墉城，修復城墻上的矮墻和房屋后駐守在這里，軍中的鑼鼓聲，在東都洛陽都能聽到；沒過多久，他率領三十多萬士兵，在北邙山列陣，向南逼近上春門。正月十九日，金紫光祿大夫段達、民部尚書韋津出兵抵抗。段達看到李密軍隊聲勢浩大，心生畏懼，率先撤退。李密率軍追擊，段達的軍隊隨即潰敗，韋津戰死。于是偃師、柏谷兩地的守軍，以及河陽都尉獨孤武都、檢校河內郡丞柳燮、職方郎柳續等人，各自率領部下向李密投降。竇建德、朱粲、孟海公、徐圓朗等人也都派使者獻上奏表勸李密稱帝，李密的下屬裴仁基等人也上奏表請求他確定國號和帝號，李密說：“東都還沒平定，不能談論這件事。”
正月二十二日，唐王任命世子李建成擔任左元帥，秦公李世民擔任右元帥，率領十幾萬軍隊救援東都洛陽。
東都洛陽糧食短缺，太府卿元文都等人招募守城但不領取公家糧食的人，授予他們散官二品的官職，于是拿著象牙笏板來上朝的商人，多得數不過來。
二月初四，唐王派太常卿鄭元璹率軍從商洛出發，攻占南陽；派左領軍府司馬、安陸人馬元規攻占安陸以及荊州、襄州一帶。
李密派房彥藻、鄭飂等人向東出兵黎陽，分路招撫慰問各州各縣。他任命梁郡太守楊汪為上柱國、宋州總管，又親手寫信給他說：“過去在雍丘，我曾被你追捕，如今我像齊桓公不計較管仲射鉤、晉文公原諒寺人披斬袖那樣，不會記恨過去。”楊汪派使者往來溝通心意，李密也用籠絡的方式對待他。房彥藻寫信招降竇建德，讓他來拜見李密。竇建德回信，辭謙卑，禮物豐厚，借口羅藝向南侵犯，請求留守北方邊境。房彥藻返回時，到達衛州，被賊帥王德仁攔擊殺害。王德仁擁有幾萬部眾，占據林慮山，四處劫掠，成為好幾個州的禍患。
三月初四，唐王任命齊公李元吉為鎮北將軍、太原道行軍元帥，總領十五個郡的軍事，允許他根據情況自行決斷事務。
隋煬帝到達江都后，更加荒淫無道，在宮中建造了一百多間房屋，每間都裝飾華麗，配備美女，每天讓一間房屋的美女做主人招待他。江都郡丞趙元楷負責供應酒菜，隋煬帝和蕭皇后以及受寵的妃嬪們輪流到各房宴飲，酒杯從不離手，跟隨的妃嬪一千多人也經常喝醉。但隋煬帝看到天下大亂，內心也煩躁不安，退朝后就頭戴方巾、身穿短衣，拄著拐杖散步，走遍宮中的樓臺館舍，不到深夜不停止，急切地觀賞景物，唯恐看不夠。
隋煬帝自己懂得觀測天象、占卜面相，喜歡說吳地方；經常在夜里擺酒，抬頭觀察天象，對蕭皇后說：“外面有很多人想算計我，但我至少還能做個長城公（南朝陳后主降隋后的封號），你也能做沈皇后（陳后主的皇后），咱們還是一起痛快飲酒吧！”說完就喝得酩酊大醉。他還曾拿起鏡子照自己，回頭對蕭皇后說：“多好的頭顱，誰會來砍它呢？”蕭皇后驚訝地問原因，隋煬帝笑著說：“富貴和貧賤、痛苦和快樂，都是交替出現的，又有什么好傷感的！”
隋煬帝看到中原已經大亂，無心返回北方，想把都城遷到丹楊（今江蘇南京），占據江東地區，于是命令大臣們在朝堂上商議這件事。內史侍郎虞世基等人都認為這個主意好；右候衛大將軍李才極力陳述不可遷都，請求隋煬帝返回長安，和虞世基憤怒爭辯后退出朝堂。門下錄事、衡水人李桐客說：“江東地勢低洼潮濕，土地狹窄，對內要供奉皇帝，對外要供給軍隊，百姓難以承受負擔，恐怕也會叛亂離散。”御史彈劾李桐客誹謗朝政。于是大臣們都迎合隋煬帝的心意說：“江東的百姓盼望陛下前去，已經很久了，陛下渡過長江，安撫統治那里，這是大禹當年做的事啊。”隋煬帝于是下令修建丹楊宮，準備遷都過去。
當時江都的糧食已經耗盡，跟隨隋煬帝的驍果軍大多是關中人，長期客居他鄉，思念家鄉，看到隋煬帝沒有返回西方的意思，很多人謀劃反叛逃回關中。郎將竇賢于是率領部下向西逃跑，隋煬帝派騎兵追上并斬殺了他，但逃亡的人還是不斷，隋煬帝對此很擔憂。虎賁郎將、扶風人司馬德戡一向受到隋煬帝的寵信，隋煬帝派他率領驍果軍駐守東城，司馬德戡和交好的虎賁郎將元禮、直閣裴虔通謀劃說：“現在驍果軍人人都想逃跑，我要是報告這件事，恐怕會先被處死；不報告，以后事情敗露，也免不了被滅族，怎么辦？而且聽說關內已經淪陷，李孝常占據華陰反叛，皇上囚禁了他的兩個弟弟，準備殺掉他們。我們的家屬都在關中，能不擔心嗎？”元禮和裴虔通都很害怕，說：“那我們該怎么辦呢？”司馬德戡說：“驍果軍要是逃跑，不如我們和他們一起逃走。”兩人都說：“好！”于是他們輾轉拉攏他人，內史舍人元敏、虎牙郎將趙行樞、鷹揚郎將孟秉、符璽郎李覆、牛方裕、直長許弘仁、薛世良、城門郎唐奉義、醫正張愷、勛士楊士覽等人都參與了謀劃，他們日夜相互聯絡約定，在大庭廣眾之下公開談論反叛的計劃，毫無顧忌。有宮女告訴蕭皇后說：“外面人人都想反叛。”蕭皇后說：“任憑你去報告皇上吧。”宮女把這件事告訴了隋煬帝，隋煬帝大怒，認為這不是宮女該說的話，把她殺了。后來又有宮女告訴蕭皇后，蕭皇后說：“天下的事情已經到了這個地步，無法挽救了，還說它干什么！只會讓皇上憂慮罷了！”從此再也沒有人敢說這件事。
趙行樞和將作少監宇文智及一向關系很好，楊士覽是宇文智及的外甥，兩人把反叛的謀劃告訴了宇文智及，宇文智及非常高興。司馬德戡等人約定在三月十五日結伙向西逃跑，宇文智及說：“皇上雖然無道，但威嚴和命令還能施行，你們逃跑，就像竇賢那樣白白送死。現在上天確實要滅亡隋朝，英雄豪杰紛紛起兵，同心反叛的人已經有幾萬，趁機干一番大事業，這是帝王的基業啊。”司馬德戡等人認為他說得對。趙行樞、薛世良請求推舉宇文智及的哥哥、右屯衛將軍、許公宇文化及為首領，約定好之后，才告訴宇文化及。宇文化及性格怯懦，聽到這件事，臉色大變，渾身冒汗，但最終還是同意了。
司馬德戡派許弘仁、張愷進入備身府，告訴認識的人說：“陛下聽說驍果軍想反叛，準備了很多毒酒，想趁著宴會，把驍果軍全都毒死，只和南方人留在這里。”驍果軍士兵都很害怕，相互轉告，反叛的計劃更加急迫。三月初十，司馬德戡召集所有驍果軍的軍官，告訴他們要做的事，軍官們都說：“聽從將軍的命令！”當天，刮起大風，塵土彌漫，白天像黃昏一樣昏暗。下午，司馬德戡偷出皇宮馬廄里的馬，偷偷磨利兵器。當天晚上，元禮、裴虔通在宮殿門外值班，專門負責宮殿內的守衛；唐奉義負責關閉城門，和裴虔通互通消息，各城門都沒有上鎖。到了三更時分，司馬德戡在東城聚集了幾萬士兵，點火和城外的人呼應。隋煬帝看到火光，又聽到外面喧鬧，問發生了什么事。裴虔通回答說：“草料場失火，外面的人在一起救火罷了。”當時宮內外已經隔絕，隋煬帝相信了他的話。宇文智及和孟秉在城外聚集了一千多人，劫持了候衛虎賁馮普樂，讓他部署士兵分頭把守街道。燕王楊倓察覺到有變故，夜里從芳林門旁邊的水洞鉆進去，到達玄武門，謊稱上奏說：“我突然中風，生命垂危，請允許我當面和陛下告別。”裴虔通等人不替他通報，把他抓起來囚禁了。三月十一日，天還沒亮，司馬德戡交給裴虔通士兵，讓他替換各城門的守衛。裴虔通從城門率領幾百名騎兵到達成象殿，宮中的守衛士兵大聲呼喊“有賊”；裴虔通于是退回，關閉了各城門，只打開東門，驅趕宮殿內的守衛士兵讓他們出去，守衛士兵都放下兵器逃跑了。右屯衛將軍獨孤盛對裴虔通說：“這是哪里來的軍隊，形勢太反常了！”裴虔通說：“事態已經這樣了，和將軍無關；將軍請不要亂動！”獨孤盛大罵說：“老賊，你說的是什么話！”來不及穿上鎧甲，就和身邊十幾個人抵抗，被亂兵殺死。獨孤盛是獨孤楷的弟弟。千牛衛獨孤開遠率領宮殿內的幾百名士兵趕到玄武門，敲著宮門請求說：“兵器都還完好，還能打敗賊兵。陛下如果出來親自指揮作戰，人心自然安定；不然的話，災禍現在就要來了！”最終沒有得到回應，士兵們漸漸散去。賊兵抓住獨孤開遠，因為敬佩他的忠義而釋放了他。在此之前，隋煬帝挑選了幾百名勇猛健壯的官奴，安置在玄武門，稱為“給使”，用來防備意外情況，待遇十分優厚，甚至把宮女賞賜給他們。司宮魏氏受到隋煬帝的信任，宇文化及等人拉攏她做內應。當天，魏氏假傳圣旨，讓所有給使都出宮去，緊急關頭，沒有一個給使在宮中。
司馬德戡等人率軍從玄武門進入皇宮，隋煬帝聽到叛亂的消息，換了衣服逃到西閣。裴虔通和元禮進軍推開左閣門，魏氏打開門，于是他們進入永巷，問：“陛下在哪里？”有個美女走出來，指了指隋煬帝藏身的地方。校尉令狐行達拔刀徑直上前，隋煬帝隔著窗扇對令狐行達說：“你想殺我嗎？”令狐行達回答說：“臣不敢，只是想護送陛下返回西方罷了。”于是扶隋煬帝走下閣樓。裴虔通本來是隋煬帝做晉王時的親信，隋煬帝看到他，說：“你不是我的親信嗎！為什么怨恨我而反叛？”裴虔通回答說：“臣不敢反叛，只是將士們思念家鄉，想護送陛下返回京師罷了。”隋煬帝說：“我正想回去，只是因為上游的運米船還沒到，現在就和你們一起回去！”裴虔通于是帶兵看守他。
到了天亮，孟秉率領披甲的騎兵迎接宇文化及，宇文化及嚇得渾身發抖說不出話，有人來拜見他，他只是低著頭靠在馬鞍上，不停地說“罪過”。宇文化及到達城門時，司馬德戡迎接拜見，把他引進朝堂，尊稱為丞相。裴虔通對隋煬帝說：“文武百官都在朝堂上，陛下需要親自出去安撫慰問。”把自己的隨從騎兵牽過來，逼迫隋煬帝騎上去；隋煬帝嫌棄馬鞍和韁繩破舊，換了新的才騎上去。裴虔通牽著韁繩、握著刀，帶著隋煬帝走出宮門，賊兵們歡呼吶喊，聲音震動大地。宇文化及大聲說：“何必帶著這個人出來，趕緊把他帶回去處死。”隋煬帝問：“虞世基在哪里？”賊黨馬文舉說：“已經被斬首了！”于是把隋煬帝帶回寢殿，裴虔通、司馬德戡等人拔出刀站在旁邊。隋煬帝嘆息說：“我有什么罪，落到這個地步？”馬文舉說：“陛下拋棄宗廟，不停巡游，對外頻繁征討，對內極盡奢侈荒淫，讓壯年男子死于戰亂，婦女兒童餓死在山溝里，士農工商失去產業，盜賊遍地興起；您只信任阿諛奉承的人，掩飾過錯，拒絕勸諫；這怎么能說沒罪！”隋煬帝說：“我確實對不起百姓；但至于你們，榮華富貴都享盡了，為什么還要這樣做！今天的事，誰是主謀？”司馬德戡說：“天下人都怨恨你，何止一個人！”宇文化及又派封德彝列舉隋煬帝的罪狀，隋煬帝說：“你是讀書人，為什么也這樣做！”封德彝羞愧地退了下去。隋煬帝的愛子趙王楊杲，當時十二歲，在隋煬帝身邊，哭得不停，裴虔通殺了他，鮮血濺到了隋煬帝的衣服上。賊兵想殺隋煬帝，隋煬帝說：“天子死有固定的方式，怎么能用電刀砍殺！拿毒酒來！”馬文舉等人不答應，讓令狐行達按住隋煬帝，逼他坐下。隋煬帝自己解下絲織的腰帶，交給令狐行達，令狐行達用腰帶勒死了他。當初，隋煬帝自己知道一定會遭遇災難，經常帶著一個裝有毒藥的瓦罐，對受寵的妃嬪們說：“如果賊兵來了，你們先喝毒藥，然后我再喝。”等到叛亂發生，他回頭找毒藥，身邊的人都逃散了，最終沒能找到。蕭皇后和宮女們拆下漆床的木板，做了一個小棺材，把隋煬帝和趙王楊杲一起埋葬在西院的流珠堂。
隋煬帝每次巡游，常常帶著蜀王楊秀，把他囚禁在驍果軍的軍營里。宇文化及殺了隋煬帝后，想擁立楊秀為皇帝，眾人商議后認為不行，于是殺了楊秀和他的七個兒子。又殺了齊王楊暕和他的兩個兒子，以及燕王楊倓，隋朝的皇族、外戚，無論老少都被殺死。只有秦王楊浩因為一向和宇文智及有往來，宇文智及用計謀保全了他。齊王楊暕一向不受隋煬帝寵愛，父子之間經常相互猜忌。隋煬帝聽到叛亂的消息，回頭對蕭皇后說：“該不會是阿孩（楊暕的小名）干的吧？”宇文化及派人到楊暕的府第殺他，楊暕以為是隋煬帝派來抓他的，說：“詔使請慢一點，我沒有辜負國家！”賊兵把他拉到街上殺了，楊暕到死都不知道殺他的人是誰，父子到死都相互不了解。宇文化及又殺了內史侍郎虞世基、御史大夫裴蘊、左翊衛大將軍來護兒、秘書監袁充、右翊衛將軍宇文協、千牛衛宇文皛、梁公蕭鉅等人以及他們的兒子。蕭鉅是蕭琮弟弟的兒子。
叛亂將要發生時，江陽縣令張惠紹騎馬趕來告訴裴蘊，裴蘊和張惠紹謀劃假傳圣旨，調發城外的軍隊逮捕宇文化及等人，然后敲門救援隋煬帝。計劃確定后，派人報告虞世基；虞世基懷疑報告叛亂的人說的不是實話，壓下了這個計劃，沒有同意。沒過多久，叛亂就發生了，裴蘊嘆息說：“和虞世基（字播郎）商量事情，最終誤了大事！”虞世基的同宗虞汲對虞世基的兒子、符璽郎虞熙說：“事態已經這樣了，我帶你向南渡過長江逃命，一起死有什么用？”虞熙說：“拋棄父親、背叛君主，哪里還有求生的地方？感謝您的關懷，但我已經決定要死了！”虞世基的弟弟虞世南抱著虞世基痛哭，請求代替他去死，宇文化及不答應。黃門侍郎裴矩知道一定會發生叛亂，即使是對仆人也都優厚對待，又建議為驍果軍士兵娶媳婦；等到叛亂發生，賊兵們都說：“這不是裴黃門的罪過。”不久宇文化及到達，裴矩在馬前迎接拜見，所以得以幸免。宇文化及因為蘇威不參與朝政，也赦免了他。蘇威的名聲和地位一向很高，前去拜見宇文化及；宇文化及召集眾人接見他，對他格外客氣，給予特殊的禮遇。文武百官都到朝堂祝賀宇文化及，只有給事郎許善心不到。
許弘仁騎馬趕去告訴許善心說：“天子已經駕崩，宇文將軍代理朝政，滿朝文武都已聚集。天道人事本就有更替終結，這事跟您有什么關系，您何必這樣遲疑不去？”許善心發怒，不肯前往。許弘仁轉身騎馬離開，哭著走了。宇文化及派人到許善心家中把他抓到朝堂，不久又放了他。許善心不行跪拜禮就走出朝堂，宇文化及發怒說：“這個人太傲慢了！”又下令把他抓回來殺掉。許善心的母親范氏，當時九十二歲，撫摸著棺材卻不哭，說：“能為國家危難而死，我有這樣的兒子，值了！”隨后臥床不進食，十多天后去世。
唐王李淵入關時，張季珣的弟弟張仲琰擔任上洛縣令，率領官吏百姓堅守城池，部下殺了他投降唐王。宇文化及叛亂時，張仲琰的弟弟張琮擔任千牛衛左右，被宇文化及殺死。張氏兄弟三人都為國家危難而死，當時的人都為自己不能像他們這樣而感到慚愧。
宇文化及自稱大丞相，總攬朝政。他以蕭皇后的名義擁立秦王楊浩為皇帝，讓楊浩住在別的宮殿里，只讓他簽署詔書、敕令而已，還派兵監視他。宇文化及任命弟弟宇文智及為左仆射，宇文士及為內史令，裴矩為右仆射。
三月初十，唐王改封秦公李世民為趙公。
三月二十三日，隋恭帝下詔書，把十個郡劃歸唐國，還任命唐王李淵為相國，總攬朝政，允許唐國設置丞相及以下官員，又賜給唐王“九錫”（古代帝王賜給重臣的九種特殊禮遇）。唐王對下屬官員說：“這是阿諛奉承的人干的事。我手握大權，卻給自己加授特殊禮遇，這合適嗎？要是效仿魏晉時期的做法，那些都是繁瑣的禮儀、虛假的裝飾，欺騙上天和百姓；考察他們的實際功業，還比不上春秋五霸，卻追求比三王（夏禹、商湯、周文王）還高的名聲，這是我一直嘲笑的，我也為此感到羞恥。”有人說：“歷代都這么做，怎么能廢除呢！”唐王說：“堯、舜、湯、武，都根據當時的情況，采取不同的方式取得天下，他們都用最大的誠意順應天意民心，沒聽說過夏、商末年一定要效仿唐、虞的禪讓。要是少帝（隋恭帝）有知覺，肯定不肯這么做；要是他沒知覺，我自己抬高自己，還假意推辭，這是我平生不愿做的事。”唐王只把丞相府改為相國府，那些九錫之類的特殊禮遇，都交給有關部門處理。
宇文化及任命左武衛將軍陳棱為江都太守，負責處理江都留守事務。三月二十七日，宇文化及下令宮內外戒嚴，聲稱要返回長安。皇后和六宮妃嬪都按照原來的規格設置宮殿，在軍營前另外搭建帳篷，宇文化及在里面處理政事，儀仗侍衛的隊伍，都仿照皇帝的規格。他強奪江都百姓的船只，打算從彭城走水路向西返回。宇文化及因為折沖郎將沈光勇猛，讓他率領“給使”營駐守在宮內。
隊伍走到顯福宮時，虎賁郎將麥孟才、虎牙郎錢杰和沈光謀劃說：“我們受先帝（隋煬帝）的厚恩，現在卻低頭侍奉仇人，受他驅使，還有什么臉面活在世上！我一定要殺了他，死也沒有遺憾！”沈光哭著說：“這正是我期望將軍做的事！”麥孟才于是聯絡先帝的舊部，率領幾千名部下，約定在第二天清晨出發時襲擊宇文化及。消息泄露，宇文化及連夜和心腹逃出營外，留下人告訴司馬德戡等人，讓他們討伐麥孟才。沈光聽到營內喧鬧，知道事情敗露，立即襲擊宇文化及的營帳，卻一無所獲，正好遇到內史侍郎元敏，就列舉他的罪狀，把他殺了。司馬德戡帶兵包圍沈光，殺了沈光，他部下的幾百人都戰死了，沒有一個投降的，麥孟才也死了。麥孟才是麥鐵杖的兒子。
武康人沈法興，家族世代是郡里的名門望族，同宗族有幾千戶人家。沈法興擔任吳興太守，聽說宇文化及殺了隋煬帝，就起兵以討伐宇文化及為名。等他到烏程時，已經擁有六萬精銳士兵，于是攻打余杭、毗陵、丹楊，都攻了下來，占據了長江以南的十個郡。他自稱江南道大總管，按照皇帝的規格設置百官。
東國公竇抗，是唐王李淵妃子的哥哥。隋煬帝派他到靈武去巡視長城；他聽說唐王平定了關中，三月二十八日，率領靈武、鹽川等幾個郡的人前來投降。
夏季，四月，稽胡（北方少數民族）侵犯富平，將軍王師仁打敗了他們。又有五萬多稽胡人侵犯宜春，相國府咨議參軍竇軌帶兵討伐，在黃欽山交戰。稽胡人占據高處放火，官軍稍有撤退；竇軌殺了十四名部將，提拔隊伍中的小校代替他們，指揮士兵再次作戰。竇軌親自率領幾百名騎兵在軍隊后面，下令說：“聽到鼓聲要是有不前進的，就從后面把他殺了！”隨后擊鼓，將士們爭相沖向敵人，稽胡人用箭射也阻止不了；官軍最終大敗稽胡人，俘虜了兩萬男女。
世子李建成等人到達東都洛陽，在芒華苑駐軍；東都守軍緊閉城門不出，李建成派人招撫勸降，守軍沒有回應。李密出兵和李建成爭奪，雙方小規模交戰，之后各自撤退。東都城里有很多人想做內應，趙公李世民說：“我們剛平定關中，根基還不穩固，軍隊遠道而來，就算攻下東都，也守不住。”于是沒有接受內應。四月初四，李世民率領軍隊返回。李世民說：“城里的人看到我們撤退，一定會來追擊。”于是在三王陵設下三重埋伏等待他們；段達果然率領一萬多人追擊，遇到埋伏被打敗。李世民追擊敗兵，抵達東都城下，斬殺四千多人。隨后設置新安、宜陽兩個郡，派行軍總管史萬寶、盛彥師帶兵駐守宜陽，呂紹宗、任瑰帶兵駐守新安，自己才返回關中。
當初，五原通守櫟陽人張長遜因為中原大亂，率領全郡歸附突厥，突厥任命他為割利特勒。郝瑗勸說薛舉，讓他和梁師都以及突厥聯合出兵奪取長安，薛舉聽從了他的建議。當時啟民可汗的兒子咄苾，號稱莫賀咄設，在五原以北建立牙帳，薛舉派使者和莫賀咄設謀劃入侵關中，莫賀咄設答應了。唐王派都水監宇文歆賄賂莫賀咄設，并且向他陳述利害關系，阻止他出兵，又勸說莫賀咄設派張長遜入朝，把五原地區歸還唐朝，莫賀咄設都聽從了。四月初五，武都、宕渠、五原等郡都投降了唐王，唐王立即任命張長遜為五原太守。張長遜又偽造詔書給莫賀咄設，讓他知道薛舉的謀劃。莫賀咄設于是拒絕薛舉、梁師都等人，不接納他們的使者。
四月二十四日，世子李建成等人返回長安。
東都洛陽的政令出不了城門，人們沒有堅守的決心，朝議郎段世弘等人謀劃響應唐軍。恰逢唐軍已經返回，他們就派人招請李密，約定在四月二十五日夜迎接李密進城。事情敗露，越王楊侗命令王世充討伐并殺了段世弘等人。李密聽說東都城里已經安定，就返回了。
宇文化及擁有十幾萬部眾，占據了隋煬帝的六宮妃嬪，自己的生活待遇和隋煬帝完全一樣。他經常在帳篷里面朝南坐著，有人向他報告事情，他就沉默不回應；退帳后，才拿出奏章和唐奉義、牛方裕、薛世良、張愷等人商議決定。他把幼主楊浩交給尚書省，派十多個衛士看守，只派令史去拿楊浩簽署的敕令，百官不再朝見楊浩。
宇文化及到達彭城，水路不通，又強奪百姓的牛車，得到兩千輛，一起裝載宮人和珍寶；至于兵器鎧甲，都讓士兵背著，路途遙遠，士兵疲憊不堪，開始產生怨恨。司馬德戡私下對趙行樞說：“你大錯特錯，耽誤了我！現在平定叛亂，必須依靠賢能的人；宇文化及平庸愚昧，身邊又都是小人，事情一定會失敗，該怎么辦？”趙行樞說：“這事全在我們，廢掉他有什么難的！”
當初，宇文化及掌權后，賜給司馬德戡溫國公的爵位，加授光祿大夫；但因為司馬德戡專門統領驍果軍，宇文化及心里很猜忌他。幾天后，宇文化及安排眾將分配士兵，任命司馬德戡為禮部尚書，表面上是提拔他，實際上是剝奪他的兵權。司馬德戡因此怨恨，把得到的賞賜都用來賄賂宇文智及；宇文智及為他說話，宇文化及才讓他率領一萬多后軍跟隨。
于是司馬德戡、趙行樞和將領李本、尹正卿、宇文導師等人謀劃，用后軍襲擊殺死宇文化及，改立司馬德戡為主帥；他們派人到孟海公那里，聯絡他作為外部援助；因為等待孟海公的回信，計劃拖延沒有實施。許弘仁、張愷知道了這個謀劃，把-->>它告訴了宇文化及。宇文化及派宇文士及假裝去打獵，到后軍軍營，司馬德戡不知道事情敗露，出營迎接拜見，宇文士及趁機把他抓了起來。宇文化及責備他說：“我和你齊心協力平定天下，經歷了無數生死。現在剛成功，正想一起守住富貴，你又為什么要反叛？”司馬德戡說：“當初殺昏君（隋煬帝），是因為痛恨他的荒淫暴虐；推舉你為主帥，你卻比他還過分；我是被形勢逼迫，不得已才這么做。”宇文化及用繩子勒死了司馬德戡，還殺了他的十多個黨羽。孟海公害怕宇文化及的勢力強大，率領部眾準備好酒肉迎接他。
李密占據鞏洛抵抗宇文化及，宇文化及不能向西前進，就率領軍隊向東郡進發，東郡通守王軌獻出城池投降。
四月二十八日，李密的將領井陘人王君廓率領部眾前來投降唐王。王君廓原本是盜賊，有幾千部眾，和賊帥韋寶、鄧豹在虞鄉聯合駐軍，唐王和李密都派使者招撫他。韋寶、鄧豹想歸附唐王，王君廓假裝和他們一致，趁他們沒有防備，發動襲擊，打敗了他們，奪取了他們的物資，投奔李密；李密對他不加禮遇，他又來投降唐王，唐王任命他為上柱國，暫代河內太守。
蕭銑登基稱帝，設置百官，仿照南朝梁的舊制。他追謚叔父蕭琮為孝靖皇帝，祖父蕭巖為河間忠烈王，父親蕭璿為文憲王，封董景珍等七位功臣為王。他派宋王楊道生攻打南郡，攻了下來，把都城遷到江陵，修復皇家園林和宗廟。蕭銑召岑文本擔任中書侍郎，讓他掌管文書，把機密事務托付給他。又派魯王張繡奪取嶺南，隋朝將領張鎮周、王仁壽等人抵抗；不久他們聽說隋煬帝被殺，都投降了蕭銑。欽州刺史寧長真也率領郁林、始安地區歸附蕭銑。漢陽太守馮盎率領蒼梧、高涼、珠崖、番禺地區歸附林士弘。
蕭銑、林士弘各自派人招請交趾太守丘和，丘和不投降。蕭銑派寧長真率領嶺南軍隊從海路攻打丘和，丘和想出城迎接，司法書佐高士廉勸他說：“寧長真的軍隊雖然多，但遠道而來，不能持久，城里能作戰的士兵足夠抵抗他們，為什么要看到敵人就屈服呢！”丘和聽從了他的建議，任命高士廉為軍司馬，率領水陸各路軍隊迎擊，打敗了寧長真，寧長真僅自身逃脫，他的部眾全被俘虜。不久有驍果軍士兵從江都來到交趾，帶來了隋煬帝被殺的消息，丘和也率領全郡歸附蕭銑。高士廉是高勱的兒子。
始安郡丞李襲志，是李遷哲的孫子，隋朝末年，他拿出家里的財產，招募了三千士兵，來保衛郡城；蕭銑、林士弘、曹武徹先后前來攻打，都沒能攻下來。李襲志聽說隋煬帝被殺，率領官吏百姓哀悼了三天。有人勸李襲志說：“您是中原的貴族，長期在這偏遠的郡里任職，漢族和少數民族的人都心悅誠服。現在隋朝沒有君主，天下大亂，憑您的威望和恩惠，在嶺南發號施令，趙佗（古代南越國君主）那樣的功業唾手可得。”李襲志發怒說：“我家世代堅守忠貞，現在江都雖然淪陷，但國家宗廟還在，趙佗狂妄稱帝，有什么值得效仿的！”他想殺了勸說的人，眾人于是不敢再說話。李襲志堅守了兩年，外面沒有援兵，城池被攻破，他被蕭銑俘虜，蕭銑任命他為工部尚書，暫代桂州總管。于是蕭銑占據了東到九江、西到三峽、南到交趾、北到漢川的地區，擁有四十多萬兵力。
隋煬帝被殺的消息傳到長安，唐王李淵哭得很悲痛，說：“我曾以臣子的身份侍奉他，他失去道義我卻不能挽救，怎么敢忘記哀悼呢！”
五月，山南撫慰使馬元規在冠軍攻打朱粲，打敗了他。
王德仁殺了房彥藻后，李密派徐世積討伐他。王德仁戰敗，五月初十，他和武安通守袁子干都來投降唐王，唐王下詔任命王德仁為鄴郡太守。
五月十四日，隋恭帝把皇位禪讓給唐王，自己退居到代王府。五月二十日，唐王李淵在太極殿登基稱帝，派刑部尚書蕭造到南郊祭天，宣布大赦天下，改年號為武德。廢除郡制，設置州制，把太守改為刺史。推算五行，唐朝屬土德，顏色以黃色為尊。