等馬芳率軍追趕上的時候，就發現俺答已經撤走了。沒有了這些人當累贅，蒙古人行軍的速度極快，馬芳根本追之不及，而且馬芳也要先把自己當面的這些北虜給消滅了。

什么，你說這不是正宗的北虜？來來來，你好好看看馬軍門手上的刀，再看看這些首級，是不是朝廷規定的斬虜賊首級一顆，賞銀二十兩的正宗北虜首級，你說不是，那丘八爺手上的刀就要好好跟你說道說道了。

馬芳指揮官軍，將俺答用于斷后的這數千人吃掉之之后，挑挑揀揀從中找出了一千五百余級，這就是騎兵作戰最不好的一點了，大量的首級被戰馬踏壞，無法用于報功，這使得官軍士卒很是心疼。

隆慶元年十月初八日，俺答率部撤回草原，官軍勝利收復磨兒山，自此，隆慶元年八月以來的俺答入寇徹底結束了，馬芳隨即向京師報捷，官軍前后大小四戰，斬獲北虜首級近三千，俺答倉皇逃竄，官軍大獲全勝。

朱載坖得知消息之后，自然是極為高興了，這是自己即位以來的第一場大勝，雖然俺答破口而入，但是并沒有攻克大明一個州縣，所能夠造成的損失也就是極為有限的。

朱載坖對此非常高興，不僅對參戰諸軍以及將領們加以賞賜，以山西今歲被虜寇為由，減免了山西的賦稅，同時命令兵部從優議功，對于朱載坖來說，這一仗算是長了他的臉面，馬芳、曹邦輔、戚繼光、李成梁都是他簡拔任用的人，實踐證明，他們能夠戰勝俺答，俺答要想再重演庚戌之變時絕不可能了。

朱載坖還下令將此戰的情況尤其是官軍的斬獲昭告天下，遣英國公告廟，并且明發上諭：十六載之積憤，一朝挫其狂峰！

自嘉靖二十九年庚戌之變以來，俺答多次進犯，雖然官軍嚴整邊墻，加強防御，但是haul從來沒有斬獲如此之多，尤其是官軍野戰沒有戰敗，這才是極大的振奮人心，經歷此戰之后，朱載坖才感覺有點皇帝的尊嚴了。他令宣大總兵曹邦輔與提督馬芳查看邊墻，制定計劃，對宣大邊墻也要展開全面的修葺。

而朱載坖在此后算是初步在朝堂之上樹立了自己的威信，可以按照自己的心意來來推行改革了。而首先就是一份來自福建的奏疏，隆慶元年十月二十日，福建巡撫都御史涂澤民請開海禁，準販東西二洋。蓋東洋若呂宋、蘇祿諸國，西洋若交趾、占城、暹羅諸國，皆我羈縻外臣，無侵叛。而特嚴禁販倭奴者，比于通番接濟之例，此商舶之大原也。

涂澤民的這份奏疏當即在朝廷引起了軒然大波，朝臣們為此爭論不休，分成了兩派，部分朝臣們認為海禁是大明祖制，而且開海會導致倭寇再次泛濫，不同意開海。

而很多出身于東南的臣子，出于各種原因，認為中國無需外夷貨物，而外夷需要中國貨物，致使利益外泄。而民為利所趨，冒著犯法也私自下海，禁之不絕，這對國家有害。開海一是可解決私通之患，將其納于官方政府管轄之中，二是可使沿海百姓獲益，三是可以使得朝廷增加賦稅。

開海與禁海兩派，為此爭論不休，而朱載坖卻沒有表現出任何傾向來，使得群臣猜不透朱載坖的想法。