首先巡河御史可以在整個河道和運河進行巡視，使潘季馴能夠全面的了解河道和運河的情況。其次就是巡河御史和總理河道或者總督河漕的關系是很親近的，因為兩位總督也都帶都御史銜，某種意義上說，巡河御史是兩位總督的直接下級。

至于現在朝廷議論比較多的到底是總督河漕一人還是總督漕運、總督河道兩人，朱載坖也有一些自己的看法，其實之前黃河水災沒有那么嚴重的時候，總督或者總理河道僅僅是臨時差遣，限以三年，務底成績，事畢則還。直到正德年間，因河患頻繁影響漕運，總理河道一職才逐漸變為定職。但總河一職固定后，與總漕在管轄范圍和權限上出現了交叉，為河漕交惡埋下禍端。

此事的關鍵節點就在嘉靖二十年，黃河、運河交匯的徐州洪、呂梁洪淺阻，影響漕運以致京師糧運不通，而總督漕運官卻將責任全部推給總理河道官，致使總河以下全都受到處罰，以此為導火索，總河與總漕徹底決裂，勢如水火。

后來嘉靖圣裁之后，令總督漕運兼管河道，也就是總督河漕，這也很多官員不同意分設的原因，他們擔心一旦分設河道和漕運，就會重蹈嘉靖二十年的覆轍。

最近不少官員的奏疏都這么人為的，他們認為：總河總漕分而為二，竟以漕為米不知為河矣，而且彼此水火，漕法始亂。

朱載坖到不這么認為，總督河漕事務實在是過于繁雜，朱載坖覺得恐怕沒有什么官吏能夠做到同時兼顧漕運和河道，運河自淮安抵通州，黃河流經河南、山東、直隸諸省，總督河漕根本不可能有這個精力同時處理河道和漕運，往往只能偏重其一，而在大明現在的情況下，肯定是偏向于漕運，這就導致河道天然的不受重視。

所以朱載坖認為，只有專設總督河道，才能夠專心治河，黃河安寧，運河才能通暢。

朱載坖的密疏到了嘉靖的案頭之后，嘉靖仔細看過后對黃錦說道：“既然裕王推薦這個潘季馴，那就讓他當這個巡河御史，火速赴河南查看河道，務必盡快恢復漕運。”

嘉靖也很清楚，眼下關于總督河道和漕運這兩個要職，一時半會恐怕朝廷還不能馬上決斷下來，朱載坖既然推薦了這個潘季馴，何妨一試呢？畢竟朱載坖之前推薦的戚繼光等人確實得力。

然后嘉靖接著吩咐黃錦道：去告訴裕王，丘富一案，為何還未審明查實？呂弼等要犯何日能夠成擒？能不能實心用事？

_l