滇軍的改變也很簡單，陳敬云給了唐繼堯兩個軍，六個師的番號。滇軍的編制比桂軍要標準的多，之前滇軍是分成了兩種編制，一種是仿效北洋以及前清新軍的四團滿編制，除了炮團和騎兵團不能滿編外，四個步兵團還是能夠滿編的，另外還大量建立了兩團制的混成旅。嚴格上來說滇軍的編制和北洋軍是極為相似的，而這樣改編起來就方便多了。

唐繼堯把駐扎在四川的兩個師以及三個混成旅合編為第六軍，還把其中兩個混成旅合編為一個師，給第六軍籌足了三個整編師另外加一個混成旅。番號分別為第十五師、第十六師、第十七師、第九混成旅，總兵力達四萬余人。軍長為韓建澤

留在云貴兩省內的其他滇軍被整編為第七軍，其中有三個師和四個混成旅。三個師直接改編為中央陸軍師，剩下的四個混成旅也不動，直接換上了中央陸軍混成旅的名號，番號分別為中央陸軍第十八師、第十九師、第二十師、第十混成旅、第十一混成旅、第十二混成旅、第十三混成旅。使得第七軍擁有三個師、四個混成旅，總兵力近六萬余。軍長由唐繼堯親自擔任。

滇軍和桂軍的整編計劃里，主要內容就是換了個部隊番號，其他的部隊編制，指揮權，乃是人事都不會變動，任舊保持原有的體系。并且這些只涉及到了主力野戰部隊，還有相當部分地方部隊并沒有納入整編計劃，陳敬云已經準備在各省設立警備司令部，負責管轄指揮各省的地方守備團等地方部隊。

國民軍、滇軍、桂軍三支軍隊完成改編后，南方聯軍將會擁有二十個中央陸軍師，十三個中央混成旅的主力野戰部隊，這些部隊之間的戰斗力肯定是相差不等的，陳敬云嫡系的部隊和陸榮廷乃是唐繼堯的部隊是沒法比的，要知道當初國民軍組建混成旅的時候，一個混成旅的作戰目標可是桂軍或者滇軍的師，而國民軍的師級部隊則是用來對抗北洋主力師的部隊。盡管里面相差甚大，但是二十個師十三個混成旅的架子總算是打出來了，南方聯軍的氣勢也就打出來了。如果加上三家剩下的那些地方守備團性質的地方部隊，那些還得再算出十幾萬的部隊來。

如此一來，南方聯軍號稱的五十萬大軍也并不是空穴來風，只是這五十萬里真正能北上和北洋打的頂多二十萬，而這個二十萬里頭主力也就是國民軍的十來萬，剩下的都是湊數的。

整編軍隊的過程中，陳敬云又任命唐繼堯和陸榮廷為統帥部副元帥，這個副元帥和陳敬云的大元帥一樣并不是軍銜，而是一種職位。而鑒于現在的國民軍乃至滇軍桂軍的高級將領，包括陳敬云和唐繼堯等人在內的軍銜都是北洋政府授予，現在南方臨時政府成立后，北洋對這些人進行通緝，自然也就不好繼續使用這些北洋政府授予的軍銜了。所以在整軍的同一時間內，統帥部對南方聯軍的高級將領進行統一授銜，這個授銜基本就是按照原有軍銜授予，少數是根據現有職位來授予，對唐繼堯和陸榮廷正式授予上將軍銜，這一次陳敬云也是順勢把自己的軍銜提升為上將。

陳敬云的大元帥、唐繼堯和陸榮廷的副元帥都不是軍銜，而是職位，上將才是他們的正式軍銜。

陳敬云在南京忙著整合南方各軍編制的時候，北洋軍和南方聯軍的戰爭也正式爆發！不過這個爆發并不是眾人之前認為的蘇南地區，也不是皖南地區，而是爆發在湖南地區。蘇南和皖南遍布國民軍和北洋軍的主力部隊，不管是國民軍要北上還是北洋軍要南下，難度都不是一般的大，一大打起來那就是規模宏大的超級大戰，加上現在的七月份正值長江流域的梅雨季節，天氣不好道路難走，所以盡管雙方已經正式撕開了臉皮，但是卻沒有立刻進行大規模的戰爭。

南方聯軍和北洋軍的第一仗是爆發在湖南！

在陳敬云就職大元帥之后，江西和廣東以及廣西的桂軍已經分三路向湖南進軍，由于陸榮廷已經加入了南方臨時政府，雖然不可能完全消除桂軍和國民軍的對抗，但是經過協商之后雙方還是從對持嚴重的廣東地區調出部隊，國民軍第三師減少了廣州以西的駐軍，轉而抽調部分部隊北上進軍湖南，陸榮廷也從廣東抽回了一個師和一個混成旅，只留下一個師預防不測。隨后雙方的從三個方向同時向湖南進軍，進攻湖南的總兵力已經超過五萬余人。剛進入湖南境內，國民軍第一混成旅就已經在湖南省陸軍第三師下屬第六旅發生交戰，從發爆發了北洋軍和南方聯軍的第一場大規模戰事！

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